進水水量
我國城市污水處理廠進水不足的現象十分普遍,這是由于污水收集網建設滯后以及設計能力問題造成的。這兩個原因導致許多地方污水處理廠已經建成多年仍然不能完全運行，一些污水處理廠只能提取周邊河道水處理，這使污水處理過程控制更加困難，也增加了工程投資成本，造成資產閑置和浪費，不必要的過度消耗已經非常緊張的污水處理資金。
比較之下，一些污水處理廠具備長期性負載運作情況，如污水處理廠一期工程等級為四十萬m3/d，二期工程經營規模為24萬m3/d，但因為資金不足，二期工程基本建設落后，一期工程項目具體產出量達52萬m3/d，解決水體降低。因此，合理確定污水處理廠建設規模和階段，有效利用污染控制資金，最大限度地提高污水收集率，是減少污水排放的前提。

進水水質
污水收集管網不匹配，雨水污水聯合流量控制網絡較為普遍，管網管理不到位，導致大量雨水、河水和工業廢水進入城市污水處理廠。
下列水質條件不利于污水處理廠的正常運行:
1.進水里的淤泥和銀鱈魚含量小于設計方案值，氮、磷等指標值相當于或高過設計方案值，因而廢水中的氮、磷較難除去。
2.工業廢水中的污染和有毒物質對城市污水處理廠的生物系統有很大的影響，在極端情況下這些污染和有毒物質使整個生物系統癱瘓，微生物菌種死亡，污水處理廠必須重新培養活性污泥
3.進水水質偏高，供氧與污泥脫水設備規格不能滿足污水與污泥處理要求。垃圾滲濾液對城市污水處理站運作的危害最該高度重視。
由于污水收集與污水處理能力之間缺乏協調,有關部門必須在近期和長期將城市排水管網和污水處理廠的建設納入城市建設規劃。同時,新的污水處理廠在污水質量的使用范圍內,以合理確定水質的設計。
出水水質
我國近年來建成的城市污水處理廠的基本要求符合gb18918-2002年國家標準b，某些地區也符合標準a。甚至最初的項目也在升級，以提高污水減排的效率。
根據污水處理排放標準的要求,城市污水處理廠采用適合當地水質和其他客觀條件的污水處理技術,加強運行管理。然而，在污水處理廠的實際運行管理過程中，仍會遇到一些來自不同方面的問題而導致處理出水水質不達標。

1.有機物超標
傳統活性污泥法的主要效果是去除城市污水中的有機污染物，設計和運行良好的活性污泥法。
影響治療效果的主要因素是：
1.營養物
城市污水中的氮、磷和其他營養素可以滿足微生物的需要，并且可以大量過剩。但工業廢水所占比例較大時，應注意核算碳、氮、磷的比例是否滿足100:5:1。假如廢水中欠缺氮，一般會添加銨鹽。如果污水中磷很少,通常可以加磷酸或磷酸鹽。
2.pH
城市污水的pH值一般為6.57.5。正是由于城市污水運輸管道中的厭氧發酵斷裂的PH值稍低可能是雨季ph值的減少往往是由城市酸雨引起的，在聯合流量系統中尤為突出。正是由PH突變的，不論是升降還是降低，通常都是工業廢水排放量大。這調整污水的pH值,通常是氫氧化鈉或硫酸,大大提高了污水處理的成本。
3.油脂
當污水含油量較高時，曝氣設備的曝氣效率會降低，若不增加曝氣量，則處理效率會降低。確保污水中高脂肪含量也降低活性污泥的沉降性能，嚴重時候污泥膨脹的原因，水標。對于含油量高的水，需要在預處理段加入。

4.溫度
溫度對活性污泥加工工藝的危害挺大。首先，溫度會影響活性污泥中微生物的活性，如果冬季溫度較低，處理效果會降低。其次，溫度的變化會影響二次沉淀池的分離性能，如溫度的變化會導致沉淀池產生異常重流，導致短流；溫度的降低會導致活性污泥由于粘度的增加而降低沉淀性能；溫度的變化會影響曝氣系統的效率。當夏季溫度升高時，由于溶解氧飽和度的降低，曝氣效率降低，空氣密度降低；如果不改變空氣供應，則必須增加空氣供應。
2.氨氮超標
根據污水中氨氮的去除主要是根據傳統的活性污泥法技術采用硝化技術，延時呼吸，降低系統的負荷。
造成廢水氨氮過剩的原因主要有以下幾個方面：
1.污泥負荷與污泥齡
生物硝化是一種低負載全過程,F/m一般是0.050.15kgBOD/kgMLVS。負荷越低，硝化進行得越充分，NH3-N向NO3--N轉化的效率就越高。與低負載對比，生物硝化系統中的srt較長，由于硝化細菌的轉化成周期時間較長，假如生物系統中的淤泥停留時間過短，即污泥沉降比過低，沒法塑造硝化細菌，沒法做到硝化反應實際效果。SRT控制在多少，取決于溫度等因素。針對以脫氮為關鍵目地的生物系統，強烈推薦應用srt11-23天。
2.回流比
生物硝化系統的回流大于傳統活性污泥工藝，主要是由于生物硝化系統活性污泥混合物中硝酸鹽含量大。通常回流比控制在50～100%。
3.水力停留時間
生物硝化反應水解酸化池的水力停留時間比曝氣生物濾池長。這關鍵是由于硝化反應速度遠遠地小于有機化學空氣污染物的除去速度，因而必須更長的反應時間。
4.BOD5/TKN
TKN是水里有機化學氮和高錳酸鹽指數之和，注入廢水中BOD5/TKN是危害硝化反應實際效果的關鍵要素。活性污泥中硝化細菌比例越小，硝化速率越小，相同操作條件下硝化效率越低。通過多家城市污水處理廠的運行實踐表明，Bod5/tkn的最佳處理范圍約為23。
5.硝化速率
生物硝化系統的一個特殊加工工藝主要參數是硝化反應速度，即每日由活性污泥法轉換為企業凈重的高錳酸鹽指數量。硝化速率的大小取決于活性污泥中硝化細菌所占的比例，溫度等很多因素，典型值為0.02gNH3-N/gMLVSS×d。
6.溶解氧
硝化細菌是一種有氧細菌，它能阻止無氧生存，硝化細菌的吸氧速率遠低于分解有機體。因而，必須維持微生物池好氧地域的溶解氧在1mg/l之上，在特殊情況下融解co2的含量也必須提升。
7.溫度
硝化細菌對溫度變化敏感，污水溫度低于15℃時硝化速度顯著降低，污水溫度低于5℃時生理活動完全停止。因此，冬季時污水處理廠特別是北方地區的污水處理廠出水氨氮超標的現象較為明顯。
8.pH
硝化細菌對pH反映很敏感，在pH為8～9的范圍內，其生物活性最強，當pH<6.0或>9.6時，硝化菌的生物活性將受到抑止并趨于停止。正因如此，盡量控制生物硝化系統的混合液PH在7.0以上。